其实大豆蛋白尽管算得上优质蛋白，但并非最优质的或最好的。大豆蛋白中一种叫作甲硫氨酸（或蛋氨酸）的必需氨基酸较少，不只比动物蛋白少，比某些谷类蛋白也少。假如用大豆做饲料喂食禽畜类动物的话 ，要别的增加一些甲硫氨酸才干满意禽畜类动物的需求。此外，大豆蛋白中赖氨酸也不太安稳 ，在大豆制品加工过程中有所丢失，导致含量缺乏。因而，大豆蛋白的营养价值比不上牛奶蛋白（乳清蛋白）、鸡蛋蛋白或肉类蛋白
。

    实际上，大豆的优势并不是蛋白质比动物性食物更好，而是大豆及其制品不含胆固醇，脂肪含量低，且主要为不饱满脂肪酸，这对防治肥壮和高血压、血脂反常、冠心病等心血管病是可贵可贵的 。为此
，1999年，美国食品药品管理局（FDA）答应大豆制品厂商声称“大豆蛋白或许削减患心脏病的危险”、“作为低饱满脂肪酸和低胆固醇膳食的一部分 ，每天吃25克大豆蛋白或许削减患心脏病的危险”
。

    此外，大豆是一切植物性食物中蛋白质含量最多，且质量最好的，而且其间赖氨酸含量丰厚 ，与谷类一同食用能经过互补效果进步全体膳食营养价值。

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